Falls das Problem noch besteht:
Unserer ist auch mal nur auf 3 Zylindern gelaufen. Da hat eine defekte Zündspule das Steuergerät (IAW 5AF) gegrillt... (Also zumindest einen der beiden Ausgänge)
Das konnte man dann auch mit einem Multimeter (Durchgangsprüfung) am Steuergerät feststellen.